RNA-PULLDOWN

RNA-PULLDOWN

RNA 與蛋白質(zhì)相互作用是細(xì)胞生理過程中的重要步驟，其中 RNA pull-down 實驗用于研究 RNA 分子與蛋白質(zhì)之間的相互作用關(guān)系。

該方法利用特定標(biāo)記的 RNA 探針（biotinylated RNA）結(jié)合目標(biāo)蛋白質(zhì)，形成 RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物，并通過親和純化形式富集出 RNA 與蛋白質(zhì)復(fù)合物，洗脫實驗后可以通過 Western blot 或質(zhì)譜等技術(shù)鑒定 RNA 與蛋白質(zhì)的結(jié)合情況。

實驗原理

RNA pull-down 實驗基于 RNA 與蛋白質(zhì)的特異性互相識別和結(jié)合，通過連接生物的素分子的 RNA 寡核苷酸可以特異性地結(jié)合目標(biāo)蛋白質(zhì)。富集 RNA 與蛋白質(zhì)之間的相互作用復(fù)合物后，可通過 Western blot 或質(zhì)譜等技術(shù)進一步研究 RNA 與蛋白質(zhì)的結(jié)合情況。

應(yīng)用途徑

RNA-PULLDOWN實驗可以用于研究 RNA 與蛋白質(zhì)之間的相互作用。其重要應(yīng)用包括鑒定 RNA 與蛋白質(zhì)復(fù)合物中的成員、篩選 RNA 結(jié)合蛋白質(zhì)的靶標(biāo)，以及研究 RNA 參與的基因表達(dá)調(diào)控機制等。